Марат Хуснутдинов родился в Москве в 2002 году. Начал заниматься хоккеем в школе «Белые медведи», после чего вместе с известным тренером Геннадием Курдиным перешёл в школу подольского «Витязя». После юниорского чемпионата мира 2019 года переехал в Санкт-Петербург и стал выступать в системе СКА. Первый матч за основной состав СКА провёл в сентябре 2020 года. В составе юниорской сборной России стал обладателем Кубка Глинки/Гретцки, а также победителем Мирового Кубка Вызова среди сборных до 17 и 20 лет. Вице-чемпион юниорского чемпионата мира 2021 года.
Обладатель Кубка Харламова сезона-2021/2022 в составе «СКА-1946». По итогам сезона-2021/2022 вместе с основной командой стал бронзовым призером чемпионата России. В феврале 2023 года стал обладателем Кубка Континента и снова завоевал бронзовые медали чемпионата страны. В сезоне-2022/2023 в составе СКА нападающий набрал 41 (11+30) очко в 63 матчах регулярного чемпионата и 7 (1+6) очков в 16 играх Кубка Гагарина. В ХК «Сочи» перешёл в результате обмена 10 октября 2023 года, первый матч за «леопардов» сыграл в Нижнекамске 12 октября. 
Односторонний контракт нападающего с ХК «Сочи» рассчитан до 30 апреля 2024 года.